L'Université Johann-Wolfgang Goethe de Frankfort coordonne le projet e-NMR de l'Union Européenne : la grille de calcul distribuée dans le domaine de physique des hautes énergies réduit les temps de calculs et permet à davantage de chercheurs d'accéder à l'exploration de structures par spectroscopie de résonance magnétique nucléaire (RMN).
La spectroscopie de résonance magnétique nucléaire est l'une des méthodes les plus utilisées en biologie structurale. Cette méthode pourrait apporter encore davantage de réponses aux questions posées en sciences de la vie si l'analyse des données n'était pas si complexe. La structure de molécules biologiques se calcule à partir de données expérimentales traitées par des programmes informatiques complexes, dont l'utilisation est difficile pour des non-spécialistes. Cet obstacle fera l'objet du projet e-NMR financé à hauteur de 2 millions d'euros par l'Union Européenne : le réseau informatique RMN sera relié au réseau mondial décentralisé haute performance de grilles (grid) de physique des hautes énergies.
Depuis avril 2006, c'est le Prof. Harald Schwalbe de l'Université de Frankfort qui coordonne les temps de mesure au sein du réseau RMN de l'UE auquel 8 pays européens participent. Pendant que des chercheurs effectuent leur travaux expérimentaux en réseau, des experts internationaux expatriés se concentrent sur le développement de programmes informatiques permettant l'interprétation de ces données. L'un d'eux, Prof. Peter Güntert, est à l'origine du logiciel déjà utilisé par la moitié des chercheurs-NMR dans le monde, mais il n'existe jusqu'à présent aucun protocole permettant l'échange de données.
Par la suite et au niveau mondial, les chercheurs devraient pouvoir se logger sur une session Internet du réseau informatique RMN. Leur calculs seront traités en un temps fortement réduit à travers la grille de calcul par des supercalculateurs. Les résultats parviennent à ces chercheurs à travers le réseau RMN. Pour cela, les programmes informatiques doivent être remis à niveau pour une utilisation à distance. Au sein du réseau électronique, des standards et des procédures, qui seront également accessibles aux développeurs de logiciels extérieurs aux équipes de recherche, doivent être établis pour l'échange de données. Une base de données avec des exemples d'utilisation, des échantillons de données test, ainsi que des formations seront mis en place à partir de cas réels. Toutes ces activités visent à favoriser l'échange scientifique entre chimistes et physiciens de la communauté existante d'utilisateurs de RMN et d'ouvrir cette méthode à d'autres disciplines.
Contact :
Prof. Harald Schwalbe, Institut für Organische Chemie und Chemische Biologie, Campus Riedberg, Max-von-Laue-Str. 9, D60438 Frankfurt - tél : +49 697 982 9737 - email : schwalbe@nmr.uni-frankfurt.de
Source : Communiqué de presse, Johann Wolfgang Goethe-Universität Frankfurt - 17/01/2008
Rédacteur : Nadia Heshmati, nadia.heshmati@diplomatie.gouv.fr
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Cette information est un extrait du BE Allemagne n° 369 du 23/01/2008 rédigé par l'Ambassade de France en Allemagne. Les Bulletins Electroniques (BE)
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